La plateforme DarwinSeq de NuvoBio contourne les limites de la biologie structurale en tirant parti des réseaux d'interaction protéique pour concevoir des peptides qui se lient à des cibles auparavant considérées comme « non médicamenteuses ».
Quel est le problème ?
La découverte informatique de médicaments repose encore fortement sur des structures protéiques statiques, mais de nombreuses protéines pertinentes pour la maladie sont dynamiques, dépendantes du contexte et manquent de conformations fonctionnelles pertinentes. Par exemple, l'IA basée sur la structure passe souvent à côté des interactions biologiques réelles et ne parvient pas à identifier les cibles médicamenteuses non ciblées à l'échelle du protéome.
Quelle est leur solution ?
La plateforme DarwinSeq de NuvoBio permet la découverte informative de peptides à l'aide de séquences et de données d'interaction validées biologiquement, plutôt que de structures protéiques statiques. En se concentrant sur la fonction des protéines, DarwinSeq apprend à développer des liants peptidiques hautement spécifiques et puissants à travers le protéome, même pour des cibles protéiques qui n'étaient auparavant pas médicamenteuses en raison d'un manque de données structurelles ou d'une flexibilité conformationnelle.